Sistemos ventiliacija turi būti įrengiama labai atsargiai. Viena vertus, fermentacijos dujos iš septinių talpų privalo būti pašalinamos. Kita vertus, privalo būti užtikrinta tinkama BIOROCK valymo įrenginio ventiliacija.
Diametras, nurodytas BIOROCK instrukcijose, yra 100mm. Tai yra Europos standartas ir būtent pagal tai BIOROCK sistema ir praėjo pirminius sertifikavimo testus bei veikia kitose valstybėse.
Jungtinėje Karalystėje plačiai naudojamas 110 mm diametras yra minimalus. Norint imtis visų reikalingų atsargumo priemonių, kaip ir su sanitarijos ventiliacijos sistema, turėtų nebūti jokių 90° išlenkimų. Sistema tobulai veiks su 45° išlenkimais be atvirkštinio nuolydžio. Įleidimo linijų diametras septinėje talpoje privalo būti bent jau lygus pastato nuotekų išleidimo vamzdžio diametrui.